В Красной армии с июля 1919 г. Окончил пехотную школу комсостава в г. Саратов (1922), бронетанковые КУКС РККА в Ленинграде (1931), курсы «Выстрел» (1938). В Гражданскую войну С.П. Сахнов 20 июля 1919 г. был призван в РККА и зачислен в кавалерийский дивизион 23-й стрелковой дивизии Южного фронта. В ее составе участвовал в подавлении контрреволюционных мятежей в тылу 9-й армии, в боях с войсками генерала А.И. Деникина на Новочеркасском направлении, на р. Маныч и под Екатеринодаром. С февраля 1920 г. служил в 99-м железнодорожном отряде в г. Балашов. Летом 1920 г. зачислен курсантом 34-х пулеметных командных курсов в г. Саратов, затем с мая 1921 г. учился в Саратовской пехотной школе комсостава. Будучи курсантом, участвовал в ликвидации бандитизма в Саратовской губ. С сентября 1922 г., после завершения обучения в школе, С.П. Сахнов был оставлен в ней командиром взвода. С октября 1927 г. был курсовым командиром, затем пом. командира роты в Саратовской школе переподготовки комсостава запаса ПриВО. С апреля 1931 г. командовал ротой в Саратовской бронетанковой школе. В феврале 1932 г. переведен в 245-й стрелковый полк 82-й стрелковой дивизии в г. Свердловск, где исполнял должности командира батальона, пом. командира и командира полка. В 1934 году служил при штабе Приволжского военного округа. С ноября 1937 по август 1938 г. прошел переподготовку на курсах «Выстрел». В октябре 1938 г. полковник С.П. Сахнов назначен командиром 71-й стрелковой дивизии им. Кузбасского пролетариата в г. Кемерово. В январе 1940 г. она была переформирована в 23-ю запасную стрелковую бригаду, а С.П. Сахнов утвержден ее командиром. Генерал-майор с 04.06.1940 г. В марте 1941 г. он назначен командиром 201-й стрелковой дивизии в г. Тюмень (дивизия сформирована в марте 1941 года в Сибирском военном округе. В мае 1941 расформирована, личный состав направлен на формирование 7-й воздушно-десантной бригады 4-го воздушно-десантного корпуса). Затем убыл с ней в состав ЗапОВО. 12 июня вступил в командование 56-й стрелковой дивизией.
В начале Великой Отечественной войны дивизия под командованием генерал-майора С.П. Сахнова в составе 4-го стрелкового корпуса 3-й армии Западного фронта вела тяжелые оборонительные бои в районе Гродно, Лиды, Новогрудка. С 30 июня находилась в окружении. 6 сентября генерал-майор С.П. Сахнов во главе группы бойцов вышел из окружения к своим войскам севернее Андреаполя, переодетым в гражданскую одежду, без документов и оружия. В течение трех месяцев находился на проверке в органах НКВД. В октябре состоял при курсах «Выстрел», затем работал по заданию уполномоченного ГКО генерал-лейтенанта С.А. Калинина в СибВО. В декабре был назначен командиром 23-й запасной стрелковой бригады, переформированной в июле 1944 г. в 23-ю запасную стрелковую дивизию. Этой дивизией он командовал до конца войны. Проделал большую работу по формированию новых воинских подразделений и частей, а также маршевых пополнений для действующей армии.
После войны генерал-майор С.П. Сахнов продолжал командовать этой дивизией. С октября 1945 г. — начальник отдела боевой и физической подготовки штаба Западно-Сибирского ВО. С июня 1948 г. был начальником военной кафедры Башкирского сельскохозяйственного института. Умер 8 марта 1950 г.
Награжден орденами Ленина, Красного Знамени, медалями.